История Федерации Киокусинкайкан России берет свое начало с 1975 года, когда под руководством Евгения Николаевича Исакова в Хабаровске начала работу секция Киокушинкай каратэ. Благодаря умению вести тренировки, личному мастерству Исакова Е.Н. стиль Киокушинкай каратэ сразу завоевал популярность в Хабаровском крае. Исаков Е.Н. регулярно выезжал в города Комсомольск-на-Амуре, Советская Гавань, Амурск, Биробиджан и другие регионы России, где проводил учебно-методические сборы, принимал кю-тесты.

На пике популярности этого стиля каратэ у всех слоев населения в СССР издается закон о запрете каратэ. Масса детей, молодежи остались без любимого, а для некоторых жизненно необходимого занятия. Закон действовал три года с 1984 по 1987 г. Но необратимый процесс демократизации в стране отменяет этот закон. После отмены закона встал вопрос о структуризации деятельности многочисленных секций. И в 1988 году в г. Хабаровске был создан и зарегистрирован клуб «Восток». В дальнейшем для расширения состава членства в Киокушинкай каратэ в 1990 году клуб «Восток» перерегистрируется в Дальневосточную Федерацию Киокушинкай каратэ. Президентом Федерации был избран Исаков Е.Н., вице-президентом – Пукас В.В., до этого руководивший филиалом «Восток» в г. Амурске. В 1991 году (во время перестройки) Исаков Е.Н. и Пукас В.В. впервые в истории России были участниками Чемпионата Мира в г. Токио, Япония.  После поездки на Чемпионат Мира Исаков Е.Н. и Пукас В.В.  задумываются о создании Организации, которая соответствовала бы как международным стандартам, так и российским. К этому времени в Дальневосточную Федерацию Киокушинкай каратэ начали поступать заявления от субъектов Дальневосточного региона о включении в Федерацию. Руководство приняло решение о создании Восточно-российской межрегиональной организации «Киокушинкай каратэ». Организация была зарегистрирована в 1993 году.  Постепенно география расширялась, секции Киокушинкай каратэ открывались всё в новых и новых городах. 

В начале 2000-х гг. создается Межрегиональная общественная организация Киокушинкай каратэ Центральной России. Со дня открытия организации бессменными руководителями являются: Президент - Алымов Александр Николаевич (V дан, ЗТ РФ), вице-президент - Артюшков Юрий Афонасьевич (IV дан), исполнительный директор - Любровских Владимир Анатольевич (IV дан). На протяжении уже более 10 лет под руководством и непосредственном участии Алымова А.Н. разработана и успешно реализуется уникальная методика подготовки спортсменов высокого класса, созданная на основе опыта советской спортивной системы и традиций восточных единоборств. Подтверждением профессионального мастерства Алымова А.Н. является его назначение в 2009 году главным тренером сборной команды России. В период с 2009 по 2014 год под его руководством национальные команды были подготовлены к 3 Чемпионатам Мира, 6 Чемпионатам Европы, 6 международным турнирам, в которых они завоевали большинство разыгрываемых медалей.

Западно-Российская Организация Киокушинкай Каратэ-до была создана в 1999 году усилиями единомышленников под руководством Сэнсея Рамиля Габдрауфовича Габбасова и Шихана Виктора Борисовича Белова. Также большой вклад в становление организации внес Сергей Геннадьевич Суворов. Всё началось с открытия отделения в Москве, и вот спустя 16 лет Западно-Российская Организация Киокушинкай Каратэ-до уже объединяет  более 7 000 спортсменов из 29 субъектов Российской Федерации, являясь одной из крупнейших организаций в России. В 2013 году в Москве под руководством президента ИКО Киокушинкайкан Канчо Шокей Мацуи и генерального секретаря ИКО Шихана Кацухито Горая было открыто центральное Додзе ЗРОКК - одно из крупнейших Додзе в Европе, которое является главным офисом Организации и находится по адресу: ул Верхняя Сыромятническая, дом 9 строение 1. В данный момент управление организацией осуществляют:  Президент – Виктор Борисович Белов (6 дан), первый вице-президент – Алексей Владимирович Башлыков (4 дан), вице-президент – Рамиль Габдрауфович Габбасов (4 дан). Ежегодно ЗРОКК проводит такие мероприятия как: Конференция черных поясов, Зимний детский лагерь,  Зимние и Летние Школы под руководством иностранных инструкторов, специальный лагерь для Бранч-чифов и многие другие.   В ближайшем будущем запланировано открытие большого специализированного центра для подготовки сборных команд по Киокушинкай Каратэ в Московской области.

Таким образом, общероссийская общественная организация "Федерация Киокусинкайкан России" (ФКР) состояла из трёх межрегиональных организаций: Восточно-Российской (ВРМОКК), Центральной России (МООКК ЦР) и Западно-Российской (ЗРОКК). Организация была официально зарегистрирована в июле 2014 года. 

Президентом Федерации Киокусинкайкан России с 2014 по 2022 год являлся Шихан Пукас Валерий Викторович (7 дан).

4 марта 2023 года на внеочередной конференции ФКР президентом Федерации Киокусинкайкан России был избран Шихан Белов Виктор Борисович (6 дан).

На сегодня общее количество членов ФКР более 50 000 человек, это крупнейшая организация, развивающая стиль Киокушинкай в России.

Основной задачей и приоритетом ФКР являются развитие Киокушинкай, сбалансированное физическое, морально-нравственное и патриотическое воспитание адептов организации. Традиционно спортсмены ФКР поднимаются на пьедесталы престижнейших российских и международных соревнований. Регулярными победами наши бойцы по праву отстаивают своё место в российской сборной команде.